1.彩超检查：良性输尿管囊肿常呈圆形或椭圆形，大小不一，而恶性输尿管囊肿则呈不规则形状，大小一般较大，并且有时伴有分隔和囊壁厚度增加的表现。

2.CT检查：良性输尿管囊肿一般密度较低，周围组织无明显浸润，且不活动，而恶性输尿管囊肿组织密度高，周围组织浸润，通常具有不规则形状和不均匀密度。

3.肾盂镜检查：通过肾盂镜可以直接观察到输尿管内囊肿，如囊壁光滑，囊液清亮，且细腻均匀常为良性输尿管囊肿，反之则常为恶性输尿管囊肿。

4.尿液检查：可以排除肾脏功能受损和肾盂肾炎等疾病引起的蛋白尿和白细胞尿，而恶性输尿管囊肿往往会导致尿液中出现血尿等现象。