呼吸暂停的主要鉴别诊断包括以下几种：

1.阻塞性睡眠呼吸暂停综合症（OSAS）：这种情况下，呼吸暂停通常与睡眠时喉部肌肉松弛，导致气道阻塞有关。患者常常产生高声音的鼾声、频繁而浅的呼吸、嘴唇发紫等现象。

2.中枢性呼吸暂停症候群：这种情况下，呼吸暂停是由于大脑信号传输中断所致。患者可能会在入睡或醒来时突然停止呼吸，直到气道被刺激或重新启动为止。这种情况一般发生于患有中枢神经系统疾病或药物不良反应的人群中。

3.睡眠危险综合症：这种情况下，呼吸暂停被视为是睡眠时心血管状况不佳的标志。患者常常在睡眠中经历呼吸暂停、过度疲劳、嗜睡、抑郁、体重变化等症状。

除此之外，其他疾病和因素也可能导致呼吸暂停，如心脏疾病、肺疾病、慢性酒精滥用、中枢神经系统疾病、药物反应等。

鉴别诊断呼吸暂停需要综合考虑症状、病史、生理检查和实验室检查结果等因素，以明确病因。医生应通过详细的询问和全面的检查，来确诊并制定个性化的治疗方案。