肝脓肿患者常常由于严重感染，出现全身性炎症反应，甚至出现其他脏器功能衰竭而需要在重症医学科监护及治疗。治疗及器官功能监护往往着重于重要器官如心、肺、肝、肾，而不太关注其他脏器。有的病人治疗期间出现视力下降，或者出现视物异常，应及时请眼科进行专科检查，眼部超声是必查的。眼内感染轻则视力下降，重则失明。发现眼内感染应尽早行手术处理。

不但眼内感染，一个部位肝脓肿也可在肝脏其他部位形成脓肿，也有出现心肌脓肿者。曾有患者在肝脓肿好转后出现猝死，结果尸检结果竟然是心肌脓肿。

肝脓肿患者之所以出现远隔部位感染，与肝脏血运丰富，感染菌沿血流“种植”在其他部位有关。