舌根部脓肿的鉴别诊断需要考虑以下因素：

1.症状：舌根部脓肿的症状主要包括舌根部肿痛、吞咽困难、喉咙痛等。若伴有深部颈部淋巴结肿大、局部红肿、发热等症状，则应考虑感染性疾病，如细菌性咽炎、淋巴结炎等。

2.医学史：患者的医学史对鉴别诊断也有一定的影响。例如，有心脏瓣膜脓肿史的患者，舌根部脓肿可能是病原微生物脓肿性心内膜炎的表现。

3.实验室检查：舌根部脓肿的实验室检查主要包括血常规、病原微生物培养等。若血常规显示白细胞计数增高、中性粒细胞比例升高，则应考虑感染性疾病。病原微生物培养可确定病原微生物种类及敏感性。

4.影像学检查：舌根部脓肿的影像学检查主要包括颈部CT、MRI等。若发现淋巴结增大或空洞样改变，则应考虑淋巴结炎或其他空洞形成的疾病。

除此之外，急性化脓性甲状腺炎、喉结核等也可能引起舌根部肿块，需与舌根部脓肿鉴别。因此，鉴别诊断需要综合考虑患者的症状、医学史、实验室检查和影像学检查等综合因素。